Το πρόγραμμα επιδιώκει να διαμορφώσει ένα στέρεο επιστημονικό και παιδαγωγικό υπόβαθρο για τους φοιτητές και τις φοιτήτριες, καλλιεργώντας κριτική σκέψη, επαγγελματική συνέπεια και κοινωνική ευαισθησία. Παράλληλα, τους εξοπλίζει με τις κατάλληλες γνώσεις και πρακτικές δεξιότητες, ώστε να μπορούν να ανταποκριθούν με αυτοπεποίθηση και αποτελεσματικότητα στις προκλήσεις της σύγχρονης εκπαιδευτικής πραγματικότητας.
Το Πρόγραμμα Σπουδών της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστήμιο Κρήτης περιλαμβάνει μαθήματα βασικών, κλινικών και εργαστηριακών επιστημών της ιατρικής, καθώς και εκτεταμένη κλινική εκπαίδευση και άσκηση σε νοσοκομειακό περιβάλλον. Το πρόγραμμα οργανώνεται σε προκλινικό και κλινικό κύκλο σπουδών και δίνει έμφαση στη σύνδεση θεωρητικής γνώσης, κλινικής πρακτικής, έρευνας και ασθενοκεντρικής προσέγγισης στην παροχή υπηρεσιών υγείας. Επιπλέον, περιλαμβάνει υποχρεωτική κλινική άσκηση σε διαφορετικές ιατρικές ειδικότητες και δυνατότητα συμμετοχής των φοιτητών σε ερευνητικές δραστηριότητες και εργαστηριακή εκπαίδευση.